Нет ли противоречий между правилами ? п.1 ст.1378гк и нормами ст. 1375 (о том ,что заявка на изобретение и полезную модель должна содержать формулу изобретения, полезной модели)
Противоречий нет. Вы подаете заявку на патентование, но имеете право внести изменения в документы. НО эти изменения не должны менять сущность заявленного изобретения. т.е. понятно, что изменения в формулы вы не сможете внести, поскольку сущность изменится. А дополнить, например, сведения о изобретении вполне можете.